Patogen - bu kasallikka olib kelishi mumkin bo'lgan mikroorganizmlar va parazitlar uchun umumiy atama. Viruslar, xlamidiya, rikketsiya, mikoplazma, bakteriyalar, spiroxetalar va zamburug'larni o'z ichiga olgan mikroorganizmlarning aksariyat qismi; parazitlarga asosan protozoa va qurtlar kiradi. Patogenlar parazit organizmlar, parazitlangan tabiiy xostlar esa hayvonlar, o'simliklar va odamlardir. Odamga yuqishi mumkin bo'lgan 400 dan ortiq turdagi mikroorganizmlar mavjud bo'lib, ular odam og'zi, burni, tomoq, ovqat hazm qilish traktida, siydik-jinsiy yo'llarida va terida keng tarqalgan.
Har bir inson hayotida 150 dan ortiq turdagi patogenlarni yuqtirishi mumkin. Oddiy immunitet funktsiyasi sharoitida ular kasallikka olib kelmaydi, hatto ba'zilari inson tanasi uchun foydalidir. Masalan, ichak florasi (E. coli va boshqalar) ko'plab vitaminlarni sintez qilishi mumkin. Ushbu floraning mavjudligi patogen bakteriyalarning ko'payishini ham inhibe qilishi mumkin, shuning uchun bu mikroorganizmlar normal mikrobiota (normal flora) deb nomlanadi. Ammo tanadagi&# 39 immuniteti pasayganda, odamlar va mikroorganizmlar o'rtasidagi muvozanat buziladi, normal flora ham kasalliklarga olib kelishi mumkin, shuning uchun ularni shartli patogenlar (shartli patogenlar) deb ham atashadi. Vujudga qo'zg'atuvchining hujumi bo'ladimi yoki yo'qmi, bir tomondan, uning immuniteti bilan bog'liq bo'lsa, boshqa tomondan, bu patogenning patogenligi va invaziyalar soniga bog'liq. Odatda, ularning soni qancha ko'p bo'lsa, kasallik ehtimoli shunchalik katta bo'ladi. Xususan, patogenligi kuchsizroq bo'lgan patogenlar kasallik keltirib chiqarishi uchun ko'proq miqdorni talab qiladi. Bir nechta mikroorganizmlar juda patogen bo'lib, vabo, chechak va quturish kabi engil yuqumli kasalliklarga olib kelishi mumkin.